7.2 Migración holobionte humano - VHS2

La secuenciación múltiple de los genomas del VHS-1 reduce significativamente el costo de secuenciamiento a escala genómica humana, por lo que los marcadores paleovirales se establecen como grandes sustitutos, no solo por ventaja económica, sino que también a nivel de la complejidad de los análisis computacionales requeridos para el estudio de la migración humana.

A propósito, el reciente genealogía genómica humana, que se posiciona como el esfuerzo más exhaustivo hasta el momento, al emplear un total de 3,601 genomas humanos actuales y 8 genomas antiguos. La historia de las migraciones humanas inferida a partir del análisis del marcador viral VHS-1, no dista significativamente de la propuesta genealógica reciente, la cual es computacionalmente mucho más demandante.

Comparación de las rutas migratorias del virus y los resultados del análsis genalógico de cerca de ~3600 genomas contemporaneos. Ambas aproximaciones dan soporte a la hipótesis del origen único del humano en el este del continente africano. Sin embargo, los eventos migratorios son capturados por la aproximación paleovirológica y no genealógica. Eventos de migración por tierra se representan con líneas amarillas; por aire/mar con la línea púrpura. Los países de origen de las cepas del presente estudio son China (rojo), Japón (naranja), Kenia (verde oscuro), Corea del Sur (púrpura), Reino Unido (azul oscuro) y Estados Unidos (azul claro). Tomado de @kolb2013using y @wohns2022unified

Figura 7.3: Comparación de las rutas migratorias del virus y los resultados del análsis genalógico de cerca de ~3600 genomas contemporaneos. Ambas aproximaciones dan soporte a la hipótesis del origen único del humano en el este del continente africano. Sin embargo, los eventos migratorios son capturados por la aproximación paleovirológica y no genealógica. Eventos de migración por tierra se representan con líneas amarillas; por aire/mar con la línea púrpura. Los países de origen de las cepas del presente estudio son China (rojo), Japón (naranja), Kenia (verde oscuro), Corea del Sur (púrpura), Reino Unido (azul oscuro) y Estados Unidos (azul claro). Tomado de [35] y [36]


Referencias

35. Kolb AW, Ané C, Brandt CR. Using HSV-1 genome phylogenetics to track past human migrations. PloS one. 2013;8:e76267.
36. Wohns AW, Wong Y, Jeffery B, Akbari A, Mallick S, Pinhasi R, et al. A unified genealogy of modern and ancient genomes. Science. 2022.